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等位基因数与可能的基因型数之间的关系

发布时间:2016-05-17 点击:
等位基因频率指群体中某特定基因座上某一个等位基因占该座位上等位基因总数的比率。基因型频率是指群体中某特定基因型个体的数目占个体总数目的比率。图1形象地描绘了等位基因频率与基因型频率之间的关系。从数学上,对于等位基因数和基因型数,如果某遗传标记存在n个等位基因,可能的基因型数量为n(n+1)/2。
    
下表中列出了DNA联合索引系统(CODIS)中13个核心STR基因座理论上可能出现的基因型的数目,数据以附录I中已报道的等位基因数量为基础。例如:附录中CSFIPO有20个等位基因,那么理论上CSFIPO可能有的基因型为20( 20 +1)/2或210种。然而许多等位基因都非常稀有,因此由其组成的基因型也罕见。在对美国728个个体组成的群体进行调查研究时发现基因座CSFIPO仅有8个等位基因,31种基因型。如果以13个STR基因座的等位基因为基础,将会有2.5×l033个基因型组合(如表所示)。但是大部分的基因型没有观察到。应用STR等位基因和基因型建立DNA群体数据库和计算STR型出现的概率将在下面的文章中介绍。