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常用遗传标记系统之mtDNA的PCR-RFLP分型

发布时间:2016-05-17 点击:
mtDNA序列多态性主要是点突变的结果,在HV-I和HV-Ⅱ区段,具有变异的碱基位置有700~800个,其中大约有2/3的碱基变异涉及限制酶识别点回文式序列的改变,构成典型的RFLP现象。在mtDNA控制区D环,有88个点突变点,其中只有21个能够采用RFLP分析。使用某种限制酶切割不同个体相应位置的DNA片段时,有些可以切断,另一些则不能切断,还有一些是切出来的片段大小不一样。根据这些结果的差异就能将不同个体区分开来。
 
检测mtDNA上的多个多态性位点的序列特点,组合起来就可以形成许多单倍型类群(haplogroups)。这种单倍型类群的个体识别力比单个多态性位点的识别力明显提高。组成这种单倍型类群的多态性位点越多,它的个体识别力就越高。下表列出了mtDNA-D环中的RFLP的位置。
现在比较常用的人mtDNA PCR-RFLP检测位点主要有以下一些:663nt HaeⅢ;3391nt HaeⅢ;4715nt HaeⅢ;4831nt Hhal;5176nt ALul;5417nt Rsal;7598nt Hhal;9824nt HinfI;10310nt NlaⅢ;10394nt Ddel;10397nt ALul;  10646nt Rsal;12406nt Hpalo列举的位点中,斜体字表示的是限制性核酸内切酶的名称。检测这些位点时使用的引物见表。